Za vzájemně alternativní jsou považovány operace produkující stejnou položku na dané lokaci. Například je možné stejnou položku vyrobit, zakoupit od různých dodavatelů nebo převézt z různých lokací.
Výběr operace je prováděn dle metody přiřazení této operace, která musí být stejná pro všechny alternativní operace. K dispozici jsou tyto možnosti:
- Priorita - Vybere operaci s nejnižší hodnotou priority. Více zde.
- Min. cena - Vybere operaci s nejnižší cenou souvisejících předcházejících operací, zdrojů a zásobníků. Více zde.
- Min. penalta - Vybrána operace s nejnižší hodnotou penalty. Více zde.
- Min. cena a penalta - Tato možnost kombinuje minimální cenu a penaltu dohromady. APS spočítá cenu i penaltu operace a vybere operaci, která minimalizuje jejich součet.