Operace lze často provádět pomocí různých alternativních zdrojů. V APS lze tyto alternativy modelovat následujícími způsoby:
- pomocí alternativních operací - každá z operací může pro výrobu využívat různé zdroje. O tom, který zdroj bude vybrán rozhoduje metoda přiřazení u operace (viz kapitola Příklad - Metoda přiřazení u operací).
- pomocí skupin zdrojů (viz kapitola Příklad - Skupiny zdrojů) - je použita jedna operace. Tato operace má zdroj operace, jehož zdroj obsahuje podřízené zdroje. Tyto podřízené zdroje jsou vzájemnými alternativami. O výběru zdroje pak rozhoduje metoda přiřazení zdroje operace (viz kapitola Příklad - Výběr zdroje na základě metody přiřazení u zdrojů operací).
- pomocí alternativních zdrojů operací - je použita jedna operace, která má více alternativních zdrojů operací. U zdrojů operací lze prostřednictvím pole Alternativní skupina (viz Struktura formuláře zdroj operace) nastavit, že se jedná o vzájemné alternativy. O tom, který z alternativních zdrojů operace bude použit rozhoduje metoda přiřazení: