Operace lze často provádět pomocí různých alternativních zdrojů. V APS lze tyto alternativy modelovat dvěma způsoby:
- pomocí alternativních operací - každá z operací může pro výrobu využívat různé zdroje.
- pomocí skupin zdrojů (viz kapitola Příklad č.9 - Skupiny zdrojů) - je použita jedna operace. Tato operace má zdroj operace, jehož zdroj obsahuje podřízené zdroje. Tyto podřízené zdroje jsou vzájemnými alternativami. O výběru zdroje pak rozhoduje metoda přiřazení zdroje operace (viz kapitola Příklad č.xxx - Výběr zdroje na základě metody přiřazení u zdrojů operací).
- pomocí alternativních zdrojů operací - je použita jedna operace, která má více alternativních zdrojů operací.